MolPrime – darmowy program na iPada iPhone do rysowania struktur cząsteczek i nie tylko Czwartek, Gru 20 2012 

MolPrime to program, który można ściągnąć przez Appstore w dwóch wersjach – darmowej, lub płatnej (0,89 Euro). Ja używam wersji darmowej, ponieważ jest dla moich potrzeb zupełnie wystarczająca.

Program jest bardzo prosty, wręcz intuicyjny w obsłudze, a dodatkowo jest bardzo ładnie wykonany, więc naprawdę miło się z niego korzysta:)

Do czego może się przydać ten program?

  • rysowanie struktur cząsteczek chemicznych – nawet bardzo zaawansowanych – można korzystać z matryc (gotowych templatów) dostępnych już w programie i je modyfikować na własne potrzeby
  • przesyłania tych struktur przez email,
  • w zakładce „composition” program podaje nam wiele informacji na temat narysowanej cząsteczki: masa cząsteczkowa, wzór sumaryczny, liczba ciężkich atomów, liczba protonodonorów, liczba protonoakceptorów, wartościowość poszczególnych atomów
  • pozwala wyszukać narysowaną strukturę poprzez ChemSpider Mobile

Informacja ze strony developera:

Description

MolPrime is a chemical structure drawing tool based on the unique sketcher from the Mobile Molecular DataSheet (MMDS).

Features:

  • draw chemical structures
  •  send structure data via email
  •  open structures from email or web
  • create graphical images of structures
  •  view structure properties
  • use structures to search Mobile Reagents and ChemSpider

 

Distillations – bezpłatny program na iPada/iPhona, dzięki któremu odkryjecie historię chemii Piątek, List 9 2012 

Nie przez przypadek alembik jest symbolem i stanowi ikonę tego darmowego oprogramowania. W końcu alembik był kiedyś podstawa chemii i alchemii. A program Distilations daje możliwość połączenia przeszłości ze współczesnością.

Za jego pomocą można słuchać specjalnie przygotowanych programów dotyczących historii science (głównie szeroko rozumianej chemii). Programy te są nagrane bardzo ładną angielszczyzną i można odsłuchiwać je w kilku tempach do wyboru.

Bardzo mi się spodobał ten program. Szczególnie w czasie dojazdów do pracy autobusem:-)

Adres strony developera programu.

ChemDoodle Mobile – darmowy, prosty program do rysowania wzorów, struktur i symulacji widm NMR na iPada Środa, List 7 2012 

Zachęcam wszystkich użytkowników iPada oraz iPhona do zainteresowania się tym darmowym oprogramowaniem.

Rysowanie wzorów jest bajecznie proste i zajmuje po prostu chwile. Interfejs programu jest naprawdę intuicyjny. Program w mig pokazuje widmo NMR i romi jeszcze więcej:-)

Co napisał producent:

Description

Draw chemical structures. Calculate properties. Simulate NMR. ChemDoodle Mobile!

NOTE: ChemDoodle® Mobile is accessed with your ChemDoodle account that is provided to you for free when you purchase ChemDoodle desktop. You can use the Guest account to access this app without purchasing ChemDoodle, but you will not be able to save your drawings.

ChemDoodle Mobile is the iPhone and iPad companion to the popular chemical publishing desktop application, ChemDoodle. ChemDoodle Mobile is a calculator for drawn organic structures. There are four main windows: Draw, Calculate, Spectra and Help. The Draw window shows a typical ChemDoodle sketcher, where you can draw and store your structures. The Calculate page calculates properties and the Spectra page simulates NMR spectra. All spectra are interactive. The Help page contains a thorough help guide.

Calculations:
1. Molecular Formula
2. Molecular Mass
3. Monoisotopic Mass
4. Degree of Unsaturation
5. Hydrogen Bond Acceptors
6. Hydrogen Bond Donors
7. Average Molecular Polarizability
8. Molar Refractivity
9. Polar Surface Area
10. logP

Spectra:
1. Mass Parent Peak (Isotopic Distribution)
2. 1H NMR
3. 13C NMR

Więcej info o programie tutaj

 

2 darmowe programy do tworzenia map myśli oraz filmy instruktażowejak ich używać – mind mapping Środa, Paźdź 10 2012 

Dla wszystkich mniej lub bardziej wtajemniczonych przedstawiam dziś dwa linki do stron, na których można pobrać 2 programy do tworzenia map myśli.

Pierwszy z nich to:

CmapTools

Można go pobrać przechodząc na adres w linku

Opis programu na stronie jest następujący:

IHMC CmapTools to program, który pozwala na tworzenie map pojęciowych do analizy sytuacji i ułatwia analizę różnych tematów, niezależnie od ich złożoności.

Dzięki IHMC CmapTools użytkownicy mogą budować, przeglądać, udostępniać i omawiać modele wiedzy w kilku krokach.

Aby to umożliwić, IHMC CmapTools udostępnia szereg narzędzi dla każdego użytkownika do budowania swoich map koncepcyjnych, a następnie udostępniania i publikacji w Internecie za pośrednictwem serwera.

Opublikowane mapy koncepcji mogą łączyć się z innymi istniejącymi mapami. IHMC CmapTools pozwala również na automatycznie utworzenie strony internetowej z wybraną mapą koncepcji.

Aby ułatwić pracę zespołową, IHMC CmapTools umożliwia edycję map jednocześnie z innymi użytkownikami w Internecie.

IHMC CmapTools jest bezpłatny dla instytucji edukacyjnych i niekomercyjnych oraz do użytku osobistego. Jest to bardzo ciekawy program dla szkół i uczelni, z którego studenci i nauczyciele mogą czerpać korzyści.

Drugi program, który rekomenduję i z którego korzystam częściej, choć ma nieco mniej możliwości, to:

FreeMind

który można pobrać tutaj

Na stronie, do której link zamieściłem powyżej znajduje się następujący opis programu:

FreeMind to darmowe i wieloplatformowe narzędzie do tworzenia tzw. map myśli. Aplikacja umożliwia szybkie zapisywanie pomysłów w strukturze drzewa. Przypomina to odręczne rysunki ilustrujące różne zagadnienia. Gotową pracę w FreeMind możemy zapisać do pliku MM lub wyeksportować do HTML, Flash, PNG, JPG, PDF i SVG.

 

Poniżej zamieszczam zrzut ekranu z jednej z moich notatek wykonanych w tym programie. Co prawda nie jest ona mapą myśli, ale daje pewne pojecie co można wykonać używając tego programu.

Krótkie filmiki instruktażowe dotyczące używania tych programów można znaleźć na stronach Zakładu Dydaktyki Chemii UJ.

Rysowanie wzorów cząsteczek, modelowanie – 3 darmowe programy dla Windowsa Poniedziałek, Wrz 17 2012 

Tym razem propozycja dla wszystkich, którzy kiedykolwiek męczyli się z rysowaniem struktur chemicznych używając zwykłych programów graficznych. Wszystkie są darmowe (do wykorzystania niekomercyjnego).

1. Pierwszy z nich poznałem pod koniec liceum i używałem przez większość czasu na studiach. Potem zmieniła się jego nazwa, a program pozostał praktycznie bez zmian. Jest bardzo prosty w obsłudze. Można powiedzieć, że intuicyjny.

SYMYX DRAW, opis ze strony: The Accelrys JDraw applet gives application developers a lightweight, no-fee structure editor for the development of custom web and rich client applications that require chemical structure queries and/or chemical structure rendering functionality.

http://accelrys.com/products/informatics/cheminformatics/draw/jdraw.php

2. ACD/ChemSketch Freeware – tego programu używam w tej chwili, ponieważ daje znacznie więcej możliwości i zawiera dodatkowo edytor wizualno tekstowy oprócz edytora wzorów.

Opis ze strony: ACD/ChemSketch Freeware is a drawing package that allows you to draw chemical structures including organics, organometallics, polymers, and Markush structures. It also includes features such as calculation of molecular properties (e.g., molecular weight, density, molar refractivity etc.), 2D and 3D structure cleaning and viewing, functionality for naming structures (fewer than 50 atoms and 3 rings), and prediction of logP.

http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/

3. Kolejnego programu jeszcze nie wyprobowałem, ale pewno zaraz zacznę się  nim posługiwać i wtedy opiszę. Póki co zamieszczę krótki opis ze strony:

EasyChem is designed to draw chemical molecules in an intuitive way, with a very high quality (designed for book-publishing). Exporting is done to various formats (PostScript, Fig, LaTeX, etc.) to help you integrate your drawing in any software you use.

http://sourceforge.net/projects/easychem/